Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tap1P21958 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tap1P21958 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tap1P21958 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms