Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms