Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms