Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P20040 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P20040 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P20040 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P20040 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P20040 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P20040 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P20040 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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P20040 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P20040 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P20040 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P20040 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P20040 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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