Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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