Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms