Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q9P14431 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Q9P14431 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms