Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms