Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms