Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtcP11725 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtcP11725 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtcP11725 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtcP11725 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms