Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms