Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms