Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa6P09092 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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