Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb1P09055 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb1P09055 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms