Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf1P07141 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf1P07141 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms