Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01664 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01664 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01664 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01664 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01664 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01664 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms