Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01638 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01638 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01638 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01638 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01638 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01638 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01638 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01638 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01638 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms