Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JtbO88824 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JtbO88824 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JtbO88824 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JtbO88824 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JtbO88824 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JtbO88824 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
JtbO88824 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JtbO88824 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
JtbO88824 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms