Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms