Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BlmO88700 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BlmO88700 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BlmO88700 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BlmO88700 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BlmO88700 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BlmO88700 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BlmO88700 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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