Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms