Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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