Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt1O88346 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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