Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfdp1O88271 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms