Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10139O88245 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10139O88245 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10139O88245 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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