Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid1O70583 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid1O70583 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms