Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SfnO70456 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SfnO70456 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SfnO70456 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SfnO70456 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SfnO70456 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SfnO70456 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SfnO70456 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SfnO70456 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SfnO70456 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SfnO70456 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SfnO70456 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SfnO70456 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SfnO70456 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms