Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtssO70370 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtssO70370 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtssO70370 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms