Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms