Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd70O55237 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd70O55237 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd70O55237 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms