Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms