Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms