Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms