Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrxO55103 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrxO55103 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrxO55103 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrxO55103 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms