Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdkO55028 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdkO55028 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms