Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms