Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms