Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms