Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limk2O54785 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limk2O54785 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limk2O54785 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms