Protein–RNA interactions for Protein: O54692

Zw10, Centromere/kinetochore protein zw10 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zw10O54692 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zw10O54692 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zw10O54692 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms