Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pik3cdO35904 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms