Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnfrsf18O35714 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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