Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NudcO35685 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NudcO35685 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NudcO35685 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NudcO35685 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms