Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms