Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Length 4,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TnxbO35452 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms