Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms