Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc1O35379 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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