Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd9O35177 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd9O35177 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms