Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kcns1O35173 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kcns1O35173 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms