Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckarO08786 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckarO08786 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CckarO08786 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CckarO08786 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CckarO08786 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms